（一）辦公室（政策法規科）
協助局領導處理機關政務，協調機關日常工作；擬訂機關事務（內部）管理各項制度規定并組織實施；負責機關基本建設和后勤保障；負責公文處理、會務辦理、電子政務、公共機構節能等工作；起草環境保護規范性文件；監督檢查環境保護法律法規、政策規定執行情況，組織開展環境保護執法監督和法制審查工作；組織開展環境保護政策調研；組織辦理人大代表建議和政協委員提案。執行環境保護宣傳教育政策、制度，開展生態環境保護宣傳教育工作。
（二）綜合環境管理科（科技標準與產業科）
負責全市環境保護督察日常工作，承擔國家、省對我市開展環保督察的相關工作；綜合協調水環境、大氣環境、土壤環境等環境管理相關工作；負責牽頭開展環保相關考核創建工作,以及其他行業創建涉及環保相關工作；牽頭編制全市環境功能區劃；組織協調環境保護技術引進；組織指導環境保護重點科技攻關和技術示范項目；負責全市環境保護科研項目管理、成果申報及推廣應用；推動環境技術管理體系建設；參與指導和推動循環經濟、低碳發展和環保產業發展。貫徹落實國家、省環境監測制度和規范，擬訂全市生態環境監測規劃、制度和規范并組織實施；組織建設和管理全市環境監測網絡；組織實施環境執法監測、污染源監測、突發環境事件環境應急和預警監測以及各種污染源專題性調查普查；組織調查評估全市環境質量狀況并進行預測預警；建立和實行環境質量公告制度，組織編報全市環境質量報告書；指導全市環境監測隊伍建設和業務工作；負責執行環境標準；負責環境統計；承擔環境保護對外交流具體事務和服務等工作。
（三）水環境管理科
監督管理水環境污染防治工作；貫徹執行水污染防治法律、法規、規章和制度，擬訂水環境功能區劃；擬訂并組織實施全市水污染防治計劃、地下水污染防治計劃；組織測算并確定水環境容量，開展水環境承載力評估；組織實施跨市縣區界水體斷面水質考核；承擔水污染物排污許可、總量控制、排污權交易等具體工作；牽頭組織城鄉集中式飲用水源保護區的劃定，督促指導飲用水源地日常環境保護工作；貫徹執行農村、農業環境保護和自然生態保護法律、法規、規章和政策；指導、協調、監督管理各種類型的自然保護區、風景名勝區、森林公園的環境保護工作；指導生態建設示范創建工作；組織評估生態環境質量狀況，監督重要生態環境建設和生態破壞恢復工作;組織協調農村環境保護工作，組織指導農村環境綜合整治工作，指導生態農業建設，參與有關部門農業面源污染防治工作。
（四）大氣環境管理科
負責大氣、噪聲、光、化石能源等污染防治的監督管理；貫徹執行大氣污染防治法律、法規、規章和制度，承擔全市大氣、噪聲、光、化石能源等污染防治和相關環境功能區劃定等工作；組織實施大氣污染防治計劃、空氣質量改善規劃、重污染天氣應對政策措施；組織測算并確定區域大氣環境容量，開展大氣環境承載力評估,牽頭組織大氣污染源解析分析研判工作；組織實施全市大氣環境質量考核；承擔大氣污染物排污許可、總量控制、排污權交易等具體工作；組織協調大氣面源污染防治工作；牽頭協調機動車排氣污染防治相關管理工作。
（五）土壤環境管理科
負責土壤、固體廢物、化學品、重金屬等污染防治的監督管理；組織開展重點行業強制清潔生產審核；擬訂并組織實施土壤污染防治計劃；擬訂全市土壤環境功能區劃，開展土壤環境質量評估；組織實施危險廢物經營許可、化學物質環境管理登記等環境管理制度，監督管理土壤污染物排污許可、總量控制、排污權交易工作；組織開展危險廢物、醫療廢物及電子等工業產品廢物專項調查和申報登記；監督管理土壤環境保護、廢舊農膜污染防治工作。
（六）行政審批科（環境影響評價科）
牽頭承辦有關行政審批事項；貫徹執行規劃、建設項目環境影響評價、環境保護“三同時”等法律、法規、規章和制度；負責規劃和建設項目環境影響評價文件的審查審批；負責對環境影響評價資質證書持證單位進行日常監督；組織開展環境影響后評估工作；負責排污許可的綜合協調。
（七）核與輻射安全管理科
組織實施核與輻射環境保護法律、法規、規章。負責核技術應用和輸變電等電磁輻射裝置及伴有放射性礦產資源建設項目環境影響評價文件審批、“三同時”監管；負責輻射安全許可管理，組織實施輻射安全監督檢查；負責輻射環境監測管理；協助國家、省環保部門開展轄區內核設施、放射性物品運輸監管；制訂本市核與輻射應急預案并組織實施；負責核與輻射事故及投訴的調查處理，參與核與輻射恐怖事件的防范與處置工作。
（八）規劃財務科
組織編制并監督實施全市環境保護規劃；參與編制我市國民經濟與社會發展規劃和主體功能區規劃；參與審核全市各類規劃中涉及環境保護的內容；負責提出環境保護領域固體資產投資規模、方向和市級環保資金安排意見，參與管理市級環保專項資金；負責環保示范工程及其他環保項目的立項申報；參與監督管理城市環保基礎設施項目；負責機關和直屬單位預算、決算、政府采購監督管理、國有資產管理、財務監督審計工作。綜合協調污染物總量控制、排污權交易工作；會同財政部門實施生態補償和斷面資金扣繳工作。
（九）人事科
負責機關和直屬單位的機構編制和人事管理、勞動工資等工作；負責環保系統領導干部雙重管理有關工作；會同有關部門做好環境保護行政管理體制改革工作；負責環保系統干部教育培訓和隊伍建設；歸口管理環境保護行政獎懲；會同有關部門做好環保系統專業技術職稱申報評審和環境保護執業資格考試工作；負責機關和直屬單位離退休人員服務管理工作。

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